El volcán Parinacota corresponde a un estratovolcán cónico, coronado por un cráter bien definido de 500 m de diámetro y unos 100 m de profundidad. Durante su etapa inicial (163-40 ka) emitió lavas-domo andesítico-silíceas a riolíticas y depósitos de caída de composición similar, que dieron origen a un estratovolcán de gran pendiente. Entre los 20 y 10 ka el volcán colapsó parcialmente hacia el oeste, originando un depósito de avalancha de detritos con un volumen cercano a los 6 km3. Desde entonces, la actividad se ha caracterizado mediante la emisión de lavas y la generación de flujos y caída piroclástica de composición andesítica, además de lahares de corto alcance, que han construido el estratovolcán actual. En forma contemporánea, se han formado un conjunto de conos piroclásticos en los flancos suroeste y sur del cono principal, denominados volcanes de Ajata, el más reciente de ellos datado entre 2,2-1,3 ka. El evento más reciente corresponde a un depósito de flujo piroclástico datado en menos de 200 años AP.